Laboratorium Diagnostyki Molekularnej, Cytogenetyki i Cytometrii

Adres: 36-200 Brzozów, ul. Bielawskiego 18 (pawilon K)
Telefon: 13 43 07 909
e-mail:  labmolcyt@szpital-brzozow.pl
 
1.Struktura : 
Laboratorium wpisane jest na listę KIDL z numerem 3421 .
Laboratorium Diagnostyki Molekularnej i Cytometrii Przepływowej bierze udział w cyklicznych ocenach kontroli jakości. Dysponuje certyfikatami:
Certyfikat  udziału międzynarodowym  systemie oceny jakości dla oceny wykrywania mutacji w genach RAS i BRAF w raku jelita grubego wydany przez European Society of Pathology (ESP) wydany w 2018roku przez Biomedical Quality Assurance Research Unit of KU Leuven Belgium.
 
Stosowane procedury są poddawane ocenom standaryzacyjnym przez właściwe organizacje międzynarodowe m.in.:  standaryzacja oceny ilościowej ekspresji genu BCR-ABL u chorych na przewlekłą białaczkę szpikową metodą RQ-PCR w roku 2014 oraz 2017 przez Zespół Pracowni Zakładu Diagnostyki Hematologicznej Szpitala Uniwersyteckiego w Krakowie kierowany przez dr hab. n. med. Tomasza Sochę w ramach EUTOS for CML.
 
2. Pracownicy laboratorium
mgr Katarzyna Koźma młodszy asystent
mgr Jarosław Kopiczak specjalista laboratoryjnej transfuzjologii medycznej, w trakcie specjalizacji laboratoryjna genetyka medyczna, asystent
mgr inż Marek Cieśla młodszy asystent
lek. Andrzej Jasiewicz  specjalizacja diagnostyki laboratoryjnej , w trakcie specjalizacji genetyka kliniczna, kierownik
prof. dr hab.n.med. Jacek Gronwald specjalizacja genetyka kliniczna, laboratoryjna genetyka medyczna nadzór merytoryczny
Pracownicy w sposób stały podnoszą swoje kwalifikacje poprzez udział w specjalistycznych szkoleniach i konferencjach ze szczególnym uwzględnieniem diagnostyki onkologicznej i hematoonkologicznej.

3. Wyposażenie i działalność diagnostyczna :
Wyposażenie laboratorium stanowią nowoczesne urządzenia diagnostyczne poddawane regularnym przeglądom atestacyjnym przewidzianym w przepisach.
 W skład laboratorium wchodzą:

  • Pracownia cytomterii przepływowej,
  • Pracownie PCR,
  • Pracownia elektroforezy,
  • Pracownia hodowli komórkowych,
  • Pracownia FISH,
  • Ciemna mikroskopowa.
  • Pracownia NGS
 
I. Pracownia Cytometrii Przepływowej
Pracownia wyposażona jest w:
  • cytometr przepływowy BD FACSCanto II firmy Becton Dickinson
  • cytometr Lyric firmy Becton Dickinson
  • wirówkę laboratoryjną MPW-351R,
  • lodówko – zamrażalka firmy BEKO
Działalność Pracowni Cytometrii:
  • diagnostyka chorób rozrostowych układu krwiotwórczego,
  • monitorowanie przebiegu leczenia,
  • ocena subpopulacji limfocytów
  • ocena komórek CD34+ w procedurze autoprzeszczepów szpiku kostnego.
 
II. Pracownie PCR
Pracownie PCR wyposażone są w:
  • komora laminarna „ALPINA S100 PCR”,
  • zestaw do izolacji kwasów nukleinowych MagCore Automated Nucleid Acid Extractor HF16Plus,
  • wirówka laboratoryjna MPW-351R,
  • wirówka Thermo Scientific Fresco 21,
  • termomikser z wyposażeniem,
  • wirówka Eppendorf Centrifuge 5430R,
  • termocykler  Real Time PCR QuantStudio 5 Applied Biosystems,
  • termocykler Real Time PCR 7500 Dx Applied Biosystems ,
  • licznik DNA/RNA (Spektrofotometr),
  • cykler Real Time system Idylla ,
  • cykler SimpliAmp ,
  • cykler Verti 96 Well Termal Cycler,
  • cykler  Mastercycler Nexus Gradient,
  • lodówka z zamrażalką firmy Liebherr,
  • lodówko – zamrażalka firmy BOSCH, 
  • komora głębokiego mrożenia ARTIKO utrzymujące temperaturę – 80 °C,
  • komora głębokiego mrożenia ARTIKO utrzymujące temperaturę – 40 °C.
Działalność pracowni PCR:
  • wykrywanie mutacji p.Val617Phe w genie JAK-2,
  • wykrywanie transkryptu  fuzyjnego BCR-ABL,
  • monitorowanie ilościowe transkryptu BCR-ABL,
  • wykrywanie obecności allelu dla genu kodującego antygen HLA-B27,
  • badanie mutacji w genach RAS (NRAS i  KRAS) oraz BRAF .

III. Pracownia elektroforezy
Pracownia wyposażona jest w
  • zestaw do elektroforezy i analizy obrazu żeli,
Działalność pracowni:
  • wizualizacja i analiza produktów reakcji PCR ,
 
IV. Pracownia Hodowli komórkowych
Pracownia wyposażona jest w:
  • inkubator-cieplarka do hodowli komórek CO2-Mammert,
  • inkubator- cieplarka do hodowli komórek CO2 -Panasonic
  • mikroskop odwrócony NIKON TS 100F,
  • komora laminarna BIO 130.
Działalność pracowni :
  • możliwość prowadzenia hodowli komórkowych .
 
V. Pracownia FISH
Wyposażenie pracowni:
  • pH-metr wodoszczelny CP-401 z elektrodą EPP-1,
  • denaturator/hybrydyzator,
  • dygestorium z łaźnią wodną i lampą bakteriobójczą UV,
  • wirówka laboratoryjna z funkcją chłodzenia z wyposażeniem,
  • dwie lodówko – zamrażalki firmy BOSCH.
Działalność pracowni :
  • możliwość wykonywania oznaczeń metodą FISH.
 
VI. Ciemnia mikroskopowa
Wyposażenie pracowni:
  • mikroskop fluorescencyjny NIKON Eclipse C ,
  • kamera cyfrowa kolorowa do mikroskopu NIKON Eclipse Ci-S,
  • mikroskopowy system do analizy obrazu do wykrywania anomalii chromosomowych,
  • program komputerowy do analizy FISH.
Działalność pracowni :
  • możliwość oceny aberracji w kariotypie oraz analizy FISH.
 
VII. Pracownia NGS
  • sekwenator Ion S5 Semiconductor Sequencer -  Ion Torrent by Thermo Fisher Scientific
  • sekwenator kapilarny Genetic Analyzer 3500,
  • lodówko – zamrażalka firmy Liebherr,
  •  komora głębokiego mrożenia Panasonic utrzymujące temperaturę – 80 °C,
  • komora głębokiego mrożenia Skadi utrzymujące temperaturę – 80 °C.
 
Działalność pracowni :
  •  ocena mutacji BRCA1 BRCA2 w tkance  guza jajnika . 
Laboratorium wykonuje badania dla potrzeb pacjentów Szpitala Specjalistycznego w Brzozowie jak i zlecone przez podmioty zewnętrzne oraz na indywidualne zlecenia pacjentów.